云南大學(xué)附屬醫(yī)院擬采購(gòu)****例細(xì)菌組裝樣本信息采集項(xiàng)目,為充分了解市場(chǎng)生產(chǎn)及供銷情況,保證采購(gòu)工作公正、公平、公開順利開展,我院擬對(duì)該項(xiàng)目進(jìn)行院內(nèi)咨詢,有意者請(qǐng)攜帶有關(guān)資料前來我院溝通洽談。
一、項(xiàng)目?jī)?nèi)容
項(xiàng)目名稱:****例細(xì)菌組裝樣本信息采集
服務(wù)具體內(nèi)容如下:
1、協(xié)助完成****例菌株的分離、培養(yǎng)及篩選。
2、實(shí)時(shí)收取樣品,樣品需采用干冰進(jìn)行運(yùn)輸,保障實(shí)驗(yàn)室樣品的質(zhì)量不因運(yùn)輸過程而受損。
3、樣品收到后應(yīng)立即開始核酸提取、質(zhì)量檢測(cè)等相應(yīng)工作,使用Agilent、Qubit或NanoDrop進(jìn)行樣品濃度檢測(cè),電泳方法進(jìn)行核酸樣品完整性檢測(cè),核酸樣品自收到之日起,于5日內(nèi)提供樣品質(zhì)量檢測(cè)報(bào)告。
4、文庫(kù)構(gòu)建:使用二代小片段文庫(kù)測(cè)序標(biāo)準(zhǔn)文庫(kù)構(gòu)建配套試劑盒進(jìn)行文庫(kù)構(gòu)建,出具對(duì)應(yīng)文庫(kù)質(zhì)檢報(bào)告。
5、測(cè)序平臺(tái):使用DNBSEQ進(jìn)行信息采集。每個(gè)樣本的目標(biāo)采集數(shù)據(jù)量不得少于 2G 的 clean data。原始下機(jī)數(shù)據(jù)測(cè)序質(zhì)量要求: Q****≥****%,Q****≥****%?;蚪M****×覆蓋度≥****%,基因區(qū)覆蓋度≥****%,平均覆蓋深度≥****×。
6、組裝及分析:使用SPAdes組裝軟件對(duì)Clean Data進(jìn)行組裝,并完成質(zhì)控統(tǒng)計(jì)(GC-depth 分析)、非一致序列(k-mer 分析)、 NT 庫(kù)比對(duì)(存在非一致序列)、基因成分分析、重復(fù)序列、非編碼 RNA、基因功能注釋(Swiss-port,KEGG,COG,CAZy,CARD,VFDB,T3SS)
7、完成個(gè)性化分析:提取出核心基因組;耐藥基因預(yù)測(cè);群體進(jìn)化與系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建;環(huán)形基因組構(gòu)建;移動(dòng)遺傳元件注釋;泛基因組分析;全基因組關(guān)聯(lián)分析;鑒定新型耐藥基因;毒力因子預(yù)測(cè)及功能研究;宿主內(nèi)微進(jìn)化分析;耐藥突變功能性驗(yàn)證等。
8、整體服務(wù)周期需在3個(gè)月內(nèi)完成。
二、采購(gòu)需求調(diào)查申請(qǐng)文件要求
1、滿足《中華人民共和國(guó)政府采購(gòu)法》第二十二條規(guī)定;
2、申請(qǐng)人未被列入“信用中國(guó)”網(wǎng)站(****
3、供應(yīng)商法人身份證復(fù)印件、經(jīng)辦人身份證復(fù)印件、經(jīng)辦人授權(quán)書(法人親自參加現(xiàn)場(chǎng)咨詢的,可不出具法定代表人授權(quán)書);
4、本項(xiàng)目不接受聯(lián)合體采購(gòu)需求調(diào)查;
5、服務(wù)方案及采購(gòu)需求調(diào)查信息一覽表,一覽表見附件。
三、資料文件報(bào)送要求及相關(guān)安排
1、報(bào)名參加單位將以上資格證明材料,按順序裝訂成冊(cè),并加蓋騎縫章(需分別加蓋公章),一式二份提交報(bào)名。
2、采購(gòu)需求調(diào)查申請(qǐng)文件遞交時(shí)間:****年5 月8日---****年5月****日上午9:****-****:****,下午****:****--****:****(法定節(jié)假日除外),未按時(shí)遞交材料視為自動(dòng)放棄,不予受理。采購(gòu)需求調(diào)查信息一覽表(附件)電子word版發(fā)送至郵箱:****@****.com。
3、采購(gòu)需求調(diào)查會(huì)材料遞交地點(diǎn):昆明市五華區(qū)青年路****號(hào)云南大學(xué)附屬醫(yī)院資產(chǎn)管理部(1號(hào)住院樓旁配電樓2樓)。
四、現(xiàn)場(chǎng)采購(gòu)需求調(diào)查會(huì)
1、采購(gòu)需求調(diào)查會(huì)時(shí)間:根據(jù)申請(qǐng)文件提交情況另行通知。
2、采購(gòu)需求調(diào)查會(huì)地點(diǎn):云南大學(xué)附屬醫(yī)院臨時(shí)門診樓****會(huì)議室(昆明市青年路****號(hào))
3、現(xiàn)場(chǎng)采購(gòu)需求調(diào)查會(huì)時(shí),將對(duì)項(xiàng)目相關(guān)事宜進(jìn)行詳細(xì)咨詢,供應(yīng)商須派熟悉相關(guān)業(yè)務(wù)及技術(shù)服務(wù)等情況的人員參會(huì),以免影響采購(gòu)需求調(diào)查會(huì)效果。
4、本次采購(gòu)需求調(diào)查僅作為本項(xiàng)目的公開招標(biāo)前的市場(chǎng)情況調(diào)查,不作為參與單位是否中標(biāo)的條件。
聯(lián)系咨詢:云南大學(xué)附屬醫(yī)院資產(chǎn)管理部
張老師 ****-****轉(zhuǎn)****
附件 云南大學(xué)附屬醫(yī)院采購(gòu)需求調(diào)查信息一覽表.doc
云南大學(xué)附屬醫(yī)院
****年5月8日